MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia eutropha JMP134 plasmid 1

Total Repeats: 2019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007337	CCTGGG	2	12	215	226	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	72384245
2	NC_007337	TTGC	2	8	228	235	0 %	50 %	25 %	25 %	72384245
3	NC_007337	GCTCCT	2	12	236	247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	72384245
4	NC_007337	CAG	2	6	258	263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384245
5	NC_007337	CGG	2	6	271	276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384245
6	NC_007337	GC	3	6	325	330	0 %	0 %	50 %	50 %	72384245
7	NC_007337	CCTT	2	8	379	386	0 %	50 %	0 %	50 %	72384245
8	NC_007337	GC	3	6	408	413	0 %	0 %	50 %	50 %	72384245
9	NC_007337	CTG	3	9	435	443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384245
10	NC_007337	CTG	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384245
11	NC_007337	CTG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384245
12	NC_007337	CTG	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384245
13	NC_007337	GCC	2	6	637	642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384245
14	NC_007337	CTG	2	6	654	659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384245
15	NC_007337	GCC	2	6	670	675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384245
16	NC_007337	GGC	2	6	678	683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384245
17	NC_007337	CG	3	6	710	715	0 %	0 %	50 %	50 %	72384245
18	NC_007337	GGC	2	6	726	731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384245
19	NC_007337	CCG	2	6	733	738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384245
20	NC_007337	GC	3	6	749	754	0 %	0 %	50 %	50 %	72384245
21	NC_007337	TGG	2	6	770	775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72384245
22	NC_007337	GCG	2	6	884	889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384246
23	NC_007337	GCC	2	6	893	898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384246
24	NC_007337	CTG	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384246
25	NC_007337	TGG	2	6	1008	1013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72384246
26	NC_007337	CTT	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384246
27	NC_007337	CGCC	2	8	1101	1108	0 %	0 %	25 %	75 %	72384246
28	NC_007337	CCG	2	6	1381	1386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384247
29	NC_007337	GCC	2	6	1399	1404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384247
30	NC_007337	GCCG	2	8	1439	1446	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
31	NC_007337	GCG	2	6	1513	1518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384247
32	NC_007337	GCC	2	6	1549	1554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384247
33	NC_007337	GCT	2	6	1565	1570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384247
34	NC_007337	TGG	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72384247
35	NC_007337	GCC	2	6	1588	1593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384247
36	NC_007337	CG	3	6	1623	1628	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
37	NC_007337	CGG	3	9	1643	1651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384247
38	NC_007337	GCT	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384247
39	NC_007337	GCG	2	6	1684	1689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384247
40	NC_007337	CG	3	6	1688	1693	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
41	NC_007337	GGTC	2	8	1697	1704	0 %	25 %	50 %	25 %	72384247
42	NC_007337	CGGCG	2	10	1742	1751	0 %	0 %	60 %	40 %	72384247
43	NC_007337	CGG	2	6	1760	1765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384247
44	NC_007337	GC	4	8	1855	1862	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
45	NC_007337	CG	3	6	1932	1937	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
46	NC_007337	CGC	2	6	1947	1952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384247
47	NC_007337	TCG	2	6	1969	1974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384247
48	NC_007337	GGC	2	6	1986	1991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384247
49	NC_007337	GC	3	6	2079	2084	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
50	NC_007337	CGG	2	6	2126	2131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384247
51	NC_007337	GTT	2	6	2139	2144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72384247
52	NC_007337	CGC	2	6	2174	2179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384247
53	NC_007337	CTGG	2	8	2238	2245	0 %	25 %	50 %	25 %	72384247
54	NC_007337	TGCG	2	8	2249	2256	0 %	25 %	50 %	25 %	72384247
55	NC_007337	TGG	2	6	2282	2287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72384247
56	NC_007337	GCTGCC	2	12	2292	2303	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384247
57	NC_007337	GCT	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384247
58	NC_007337	GGCC	2	8	2339	2346	0 %	0 %	50 %	50 %	72384247
59	NC_007337	TCG	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384247
60	NC_007337	CAG	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384248
61	NC_007337	CGG	2	6	2678	2683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384248
62	NC_007337	GCCG	2	8	2699	2706	0 %	0 %	50 %	50 %	72384248
63	NC_007337	GTC	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384248
64	NC_007337	GAT	2	6	2725	2730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384248
65	NC_007337	CTT	2	6	2734	2739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384248
66	NC_007337	CCT	2	6	2757	2762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72384248
67	NC_007337	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384248
68	NC_007337	TCA	2	6	2786	2791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72384248
69	NC_007337	TCGCCG	2	12	2807	2818	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	72384248
70	NC_007337	TCC	2	6	2894	2899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72384248
71	NC_007337	GCA	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384248
72	NC_007337	CG	3	6	2928	2933	0 %	0 %	50 %	50 %	72384248
73	NC_007337	GTC	2	6	2947	2952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384248
74	NC_007337	GCCA	2	8	2954	2961	25 %	0 %	25 %	50 %	72384248
75	NC_007337	GGC	2	6	2962	2967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384248
76	NC_007337	TCG	2	6	2972	2977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384248
77	NC_007337	TTC	2	6	2981	2986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384248
78	NC_007337	TGA	2	6	3009	3014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384248
79	NC_007337	CAG	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384248
80	NC_007337	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384248
81	NC_007337	CTT	3	9	3136	3144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384248
82	NC_007337	CGTTG	2	10	3198	3207	0 %	40 %	40 %	20 %	72384248
83	NC_007337	CG	3	6	3302	3307	0 %	0 %	50 %	50 %	72384248
84	NC_007337	TGA	2	6	3315	3320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384248
85	NC_007337	CGC	2	6	3372	3377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384248
86	NC_007337	GC	3	6	3376	3381	0 %	0 %	50 %	50 %	72384248
87	NC_007337	TCG	2	6	3461	3466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384248
88	NC_007337	GCC	2	6	3499	3504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384248
89	NC_007337	GCC	2	6	3512	3517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384248
90	NC_007337	GCT	2	6	3519	3524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384248
91	NC_007337	CAG	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384248
92	NC_007337	CTT	3	9	3595	3603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384248
93	NC_007337	GCAC	2	8	3664	3671	25 %	0 %	25 %	50 %	72384249
94	NC_007337	CG	3	6	3688	3693	0 %	0 %	50 %	50 %	72384249
95	NC_007337	TCT	2	6	3698	3703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384249
96	NC_007337	CG	3	6	3754	3759	0 %	0 %	50 %	50 %	72384249
97	NC_007337	CTG	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384249
98	NC_007337	GTT	2	6	3813	3818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72384249
99	NC_007337	CG	3	6	3835	3840	0 %	0 %	50 %	50 %	72384249
100	NC_007337	TGA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384249
101	NC_007337	TCT	2	6	3917	3922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384249
102	NC_007337	GCC	2	6	3988	3993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384249
103	NC_007337	AGGG	2	8	4009	4016	25 %	0 %	75 %	0 %	72384249
104	NC_007337	GAA	2	6	4041	4046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72384249
105	NC_007337	GCG	2	6	4078	4083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384249
106	NC_007337	GCC	2	6	4084	4089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384249
107	NC_007337	TCC	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72384249
108	NC_007337	GC	3	6	4177	4182	0 %	0 %	50 %	50 %	72384249
109	NC_007337	TCG	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384249
110	NC_007337	CCG	2	6	4192	4197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384249
111	NC_007337	GGCC	2	8	4235	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	72384249
112	NC_007337	CCG	2	6	4465	4470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384249
113	NC_007337	CGC	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384249
114	NC_007337	GC	3	6	4607	4612	0 %	0 %	50 %	50 %	72384249
115	NC_007337	CGC	2	6	4652	4657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384249
116	NC_007337	TTC	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384249
117	NC_007337	TCT	2	6	4822	4827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384250
118	NC_007337	GAA	2	6	4866	4871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72384250
119	NC_007337	TCA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72384250
120	NC_007337	CCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384250
121	NC_007337	CCA	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72384250
122	NC_007337	GC	3	6	4997	5002	0 %	0 %	50 %	50 %	72384250
123	NC_007337	CCGG	2	8	5070	5077	0 %	0 %	50 %	50 %	72384250
124	NC_007337	CGG	2	6	5097	5102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384250
125	NC_007337	GTAGG	2	10	5103	5112	20 %	20 %	60 %	0 %	72384250
126	NC_007337	T	6	6	5118	5123	0 %	100 %	0 %	0 %	72384250
127	NC_007337	GAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	72384251
128	NC_007337	GGCC	2	8	5334	5341	0 %	0 %	50 %	50 %	72384251
129	NC_007337	TTG	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72384251
130	NC_007337	GCA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384251
131	NC_007337	CGG	2	6	5382	5387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384251
132	NC_007337	GGCGCG	2	12	5399	5410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384251
133	NC_007337	GCT	2	6	5415	5420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384251
134	NC_007337	TGA	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384251
135	NC_007337	CCGGC	2	10	5670	5679	0 %	0 %	40 %	60 %	72384252
136	NC_007337	GCC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384252
137	NC_007337	CAT	2	6	5804	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72384252
138	NC_007337	CGG	2	6	5826	5831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384252
139	NC_007337	GTCG	2	8	5840	5847	0 %	25 %	50 %	25 %	72384252
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250	NC_007337	TGGCTG	2	12	12004	12015	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	72384260
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253	NC_007337	GTCG	2	8	12108	12115	0 %	25 %	50 %	25 %	72384260
254	NC_007337	CGG	3	9	12122	12130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384260
255	NC_007337	GAT	2	6	12298	12303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384261
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259	NC_007337	CGA	2	6	12373	12378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384261
260	NC_007337	CTT	2	6	12502	12507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384261
261	NC_007337	ACGATT	2	12	12534	12545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	72384261
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263	NC_007337	GTGG	2	8	12655	12662	0 %	25 %	75 %	0 %	72384261
264	NC_007337	GCA	2	6	12685	12690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384261
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266	NC_007337	CCG	2	6	12735	12740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384261
267	NC_007337	GAT	2	6	12769	12774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384261
268	NC_007337	CCGGC	2	10	12775	12784	0 %	0 %	40 %	60 %	72384261
269	NC_007337	CGG	2	6	12833	12838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384261
270	NC_007337	GAT	2	6	12908	12913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384261
271	NC_007337	GGC	2	6	12928	12933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384261
272	NC_007337	CGCGAA	2	12	12977	12988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384261
273	NC_007337	GCT	2	6	13030	13035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384261
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290	NC_007337	CGA	2	6	13780	13785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384261
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381	NC_007337	CCG	2	6	19433	19438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384264
382	NC_007337	ATT	2	6	19828	19833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	72384265
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385	NC_007337	ACT	2	6	20036	20041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	72384265
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387	NC_007337	GTA	2	6	20110	20115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384265
388	NC_007337	CAGTG	2	10	20204	20213	20 %	20 %	40 %	20 %	72384265
389	NC_007337	CA	3	6	20215	20220	50 %	0 %	0 %	50 %	72384265
390	NC_007337	CCA	2	6	20272	20277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	72384265
391	NC_007337	GCG	2	6	20367	20372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	72384265
392	NC_007337	GGT	2	6	20600	20605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	72384265
393	NC_007337	TCC	2	6	20609	20614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	72384265
394	NC_007337	GAT	2	6	20624	20629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	72384265
395	NC_007337	TCG	2	6	20695	20700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384265
396	NC_007337	CGGA	2	8	20735	20742	25 %	0 %	50 %	25 %	72384265
397	NC_007337	GTT	2	6	20764	20769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	72384265
398	NC_007337	GCT	2	6	20774	20779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384265
399	NC_007337	GCCC	2	8	20840	20847	0 %	0 %	25 %	75 %	72384265
400	NC_007337	GAC	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	72384265
401	NC_007337	CTT	2	6	20885	20890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	72384265
402	NC_007337	CGC	2	6	20950	20955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384266
403	NC_007337	AATG	2	8	20987	20994	50 %	25 %	25 %	0 %	72384266
404	NC_007337	T	7	7	21140	21146	0 %	100 %	0 %	0 %	72384266
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411	NC_007337	TCG	2	6	21875	21880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	72384267
412	NC_007337	GCTT	2	8	21915	21922	0 %	50 %	25 %	25 %	72384267
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422	NC_007337	GAG	2	6	22554	22559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	72384267
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492	NC_007337	CG	3	6	26022	26027	0 %	0 %	50 %	50 %	72384271
493	NC_007337	CGC	2	6	26035	26040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384271
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500	NC_007337	GCC	2	6	26291	26296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	72384271

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